胃癌的全球发病率和死亡率持续高涨,受到其显著的异质性和复杂的肿瘤微环境影响,传统治疗方法往往难以达到预期效果。因此,科研人员迫切需要开发更为有效的治疗策略和早期诊断手段以应对这一挑战。
空间多组学技术在保持组织空间结构完整性的同时,能够深入分析基因、蛋白质等多种生物分子。而单细胞测序技术则可以解析单个细胞的基因表达谱,揭示细胞异质性及不同细胞亚群的功能差异和药物敏感性。将这两种技术结合,可实现对肿瘤微环境中细胞相互作用的更全面分析。
案例研究展示空间与单细胞技术在胃癌研究中的应用
案例一:空间与单细胞技术揭示胃癌组织异质性
文献名称:Spatiallyresolvedmulti-omicshighlightscell-specificmetabolicremodelingandinteractionsingastriccancer,期刊:Nature Communications,影响因子:177,发表时间:2023年。
使用了7例未接受放化疗的男性胃癌患者的术后癌组织,构建了人胃癌SGC7901细胞裸鼠异种移植瘤模型,分析了代谢物、脂质和基因表达的空间分布特征。通过整合空间代谢组学、脂质组学和转录组学,本研究揭示了胃癌组织中的显著代谢异质性。发现精氨酸、脯氨酸及脂质代谢通路在胃癌中经历了重编程,同时在肿瘤界面区域观察到免疫代谢重编程现象。这一研究为癌症治疗策略的制定提供了潜在靶点。
案例二:深入探索胃癌细胞“身份”的空间与单细胞技术
文献名称:“Single-cellatlasoflineagestates,tumormicroenvironment,andsubtype-specificexpressionprogramsingastriccancer”,期刊:Cancer Discovery,影响因子:382,发表时间:2022年。
选取31名不同阶段和亚型的患者样本,进行单细胞测序及数字空间蛋白组分析。研究确定了34种不同细胞谱系状态,发现浆细胞比例增加是弥漫型肿瘤的新特征,揭示了与KLF2相关的发病程序,并确定特定癌症相关成纤维细胞亚群可作为不良预后的重要预测因子,为理解胃癌的细胞异质性提供了新视角。
案例三:空间与单细胞技术在胃癌患者“病情分层”的应用
文献名称:“Stroma-associatedreactiveinvasionfrontareas(SARIFA)-anewprognosticbiomarkeringastriccancerrelatedtotumor-promotingadipocytes”,期刊:Journal of Pathology,影响因子:9883,发表时间:2022年。
本研究通过SARIFA阳性和阴性分型,利用空间转录组技术深入探讨差异基因表达情况。研究发现SARIFA阳性肿瘤与晚期分期、远处转移等因素相关,为负面预后因素。通过发掘具有临床意义的生物标志物,研究推动了胃癌治疗的个性化方案,从而改善患者的预后。
案例四:揭示胃癌免疫治疗的神秘面纱
文献名称:Acta2expressionpredictssurvivalandisassociatedwithresponsetoimmunecheckpointinhibitorsingastric cancer,期刊:Clinical Cancer Research,影响因子:89,发表时间:2023年。
分析567例患者的临床信息及Acta2基因表达,结果表明Acta2的表达与患者生存期密切相关,并且与免疫检查点抑制剂(ICI)治疗反应密切相关。此外,HER2/cortactin的共表达与生存期显著相关,为胃癌个性化治疗提供新的思路和依据。
通过这些案例,空间与单细胞技术的结合不仅能帮助我们更好地理解胃癌的复杂性,还为开发更有效的治疗策略提供了新的视角。这种前沿的研究方向在医疗生物领域如尊龙凯时所倡导的,将推动癌症治疗的革新。